Ing. Jana Martínková

2026 - 2028

The project builds on the outputs of the previous SGS project of the same name. Its overall objective is to continue work in promising areas of software engineering. Compared to the previous project, changes in the research team and progress in the areas under investigation have led to changes in the primary areas of research. This year, we will therefore focus primarily on the following areas: 1. Model-driven software development (MDE) and normalized software systems (NSS). 2. Advanced processing and visualization of medical data.

2023 - 2026

Projekt ELIXIR CZ, Česká národní infrastruktura pro biologická data, je zaměřen na zpracování, uchovávání, sdílení a analýzu dat v oblasti věd o živé přírodě. Cílem projektu je zajistit, aby data generovaná ostatními infrastrukturami splňovala kritéria FAIR – findable, accessible, interoperable and reusable, nutná k jejich plnému využití. Infrastruktura ELIXIR CZ je založena na expertní části zajišťované unikátním know-how špičkových odborníků z oblasti bioinformatiky, genomiky, biologie, medicíny, informatiky a počítačového inženýrství a na technické části spočívající v heterogenním souboru hardware a software prostředků a specifických architektur podle povahy zpracovávaných dat. Toto unikátní technické řešení je naplňováno především přímým zapojením e-infrastruktur zodpovědných za pokročilá IT řešení, budování datových úložišť, přístup k datům a výpočetním kapacitám. Cílem infrastruktury ELIXIR CZ je provozování pokročilých bioinformatických nástrojů, unikátních a zároveň interoperabilních datových zdrojů pro všechna odvětví současné biologie, školení odborníků a řešení pro dedikaci výpočetních prostředků a jejich specifických technických parametrů podle potřeb uživatelské komunity. Základním prvkem pro přístup a sdílení dat jsou nástroje pro autorizaci a autentizaci uživatelů, které umožňují přístup k datovým zdrojům a nástrojům. Jde většinou o vysoce rozvinuté metody, které jsou na základě schopnosti identifikovat uživatele používány pro přístup k datovým zdrojům včetně těch, které se týkají vysoce citlivých dat. Obecně představuje toto řešení technologii použitelnou ve všech disciplínách pracujících se sdílenými daty napříč vědami o živé přírodě a v podstatě i mimo ni. ELIXIR CZ se výrazně profiluje v oblasti správy dat (Data Management), a to od úrovně uživatelů po úroveň administrátorů vědeckých projektů. Koncepce a nástroje v této oblasti jsou aplikovatelné na řešení procesů od generování dat po jejich archivaci a využitelnost.

2024 - 2028

Projekt NRP pro výzkumná data přímo reaguje na potřebu podpory implementace iniciativy EOSC v ČR vytvořením a pilotním provozem Národní repozitářové platformy jako klíčového prvku Národní datové infrastruktury, definované v koncepčním dokumentu „Architektura implementace iniciativy EOSC v ČR“ . Výzkumná komunita v ČR v současné době trpí vysokou roztříštěností výzkumných dat a absencí koncepce jejich správy. Iniciativa EOSC a podpora péče o data v souladu s FAIR principy si klade za cíl konsolidovat prostředí výzkumných dat a poskytnout zázemí, nástroje i postupy, které tomuto cíli napomohou. Projekt NRP pro výzkumná data se proto soustředí na realizaci klíčových komponent, které systémově přispějí k výraznému zlepšení současného stavu v oblasti správy výzkumných dat. Hlavní výstupy se tak soustředí na rozvoj architektury Národní datové infrastruktury (NDI) a specificky NRP jako její ústřední součásti (a to včetně náležitého zabezpečení a technické podpory), zprovoznění konkrétních platforem pro tvorbu repozitářů NRP, pilotní provoz vybraných repozitářů a „catch-all“ repozitáře, implementovaných v rámci NRP, zajištění funkčních vazeb mezi konkrétními repozitáři a systémem užívání PID, zajištění komponent pro napojení repozitářů na Národní metadatový adresář a zajištění podpory pro práci s licencemi, vývoj integrovaného řešení pro plánování správy dat, stejně tak jako vytvoření koordinované vzdělávací podpory pro efektivní využití NRP.

2024 - 2027

The project deals with streamlining the work with FAIR data in research - their planning (plan), monitoring (track) and evaluation (assess). It is primarily about introducing interoperability between existing DMP creation tools, SKG-type services and evaluation tools. Likewise, other supporting tools related to research data management will be incorporated. The results of the project will be verified by a number of pilots across Europe.